Хакеры напали на сайт «Крым Онлайн» 11 марта 2014 года. В сообщении на сайте говорится о том, что портал был подвержен DDoS-атаке и дважды заблокирован, именно по этой причине сайт временно переходит на российскую доменную зону.

Представителям портала было прислано письмо, в котором говорилось о жалобе на «Крым Онлайн». В частности, в послании отмечалось нарушение правила пользования хостингом (пункты 5.5 и 5.6, http://besthosting.com.ua/ru/rules.php), кроме того, в письме утверждалось, что Referendum2014.org.ua противоречит законодательству Украины. По информации ИТАР-ТАСС, управление информационной политики совета министров Автономной Республики Крым сообщило, что хакерские действия, направленные на сайт референдума, принадлежат США и Украине.